3年生の理科で、綿を栽培教材にできますか?

できます。

3年生では、一般的に【ホウセンカ】【マリーゴールド】【ヒマワリ】が扱われています。
2種類以上の植物を継続的に栽培・観察することになっていますので、その1つを綿にすれば、よい学習教材になると思います。
東京書籍の理科の教科書には、3年生の栽培植物の例として、綿が紹介されています。

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